Il existe de nombreuses applications qui tournent sur un système LINUX, et celles-ci évoluent très rapidement. La grande majorité des programmes Unix ont été développés par ce qu'il convient d'appeler la "communauté Internet" qui rassemble des milliers d'ingénieurs, de professeurs, de professionnels ou d'amateurs du monde entier. Beaucoup des sources des programmes Unix sont sous licence GNU/GPL (copyleft), c'est à dire qu'ils sont disponibles, gratuits, ouverts, et qu'il est possible de se les appropprier afin d'en modifier les instructions. La principale contrainte de la licence des Logiciels Libres ou Open Source est de mettre la nouvelle version à la disposition de la communauté afin que tous puissent en profiter et éventuellement approrter d'autres améliorations. L'état d'esprit "hacker " des pionniers, la réactivité et la sollicitude de la communauté Internet, les rapports de bogues ou les demandes de nouvelles fonctionnalités des utilisateurs ont contribués à faire d'Internet un espace de liberté, d'innovation et de passion, et ont permis l'évolution des applications Linux en des outils puissants, sécurisés, universels et conviviaux.

Certaines applications sont conçues pour tourner sur certaines architectures matérielles, en mode console ou en mode graphique. Les applications conçues pour fonctionner avec le serveur X Window contiennent généralement un "x" dans leur nom. Les applications conçues par l'équipe GNOME contiennent généralement un "g" dans leur noms. Les applications conçues par l'équipe KDE contiennent généralement un "k" dans leur noms.

Les applications Linux:

• Les  applications systèmes
• Les applications bureautiques
• Les applications multimédia
  
• Les applications Internet
• Les applications jeux
• Les applications de sécurité
• 
  

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Les gestionnaires de fichier

• GNU Midnight commander ("gmc")
• KDE File Manager ("kfm")
• TKDESK
• 
  

Les fenêtres de terminal (sous X)

• xterm
• nxterm (GNOME)
• gnome-terminal
• kterm
• kvt (KDE)
  
• rxvt
• dtterm (CDE)
• 
  

Les émulateurs Windows

• dosemu (application permettant d'exécuter des programmes MS-DOS en mode virtuel)
• wine (émulateur de Windows avec des DLL Linux. Le fichier de configuration est "wine.conf")
• wabi
• 
  

Les logiciels de configuration

• Yast (Yet Another Configuration Tool)
• linuxconf (logiciel de configuration Linux de Mandrake)
• sndconfig (configuration d'une carte son compatible Sound Blaster)
• 
  

Les gestionnaires d'affichage (serveur X ou Display Manager)

• xdm
  
• gdm
• kdm
• 
  

Les gestionnaires de fenêtres (Window Manager)

• AfterStep
• olwm
• ctwm
• bowman
  
• LessTifMVWM
• fvwm
• fvwm95
  
• fvwm2
• Window Maker
• Enlightenment (Interface de GNOME)
• Fvwm95 (Interface Another Level)
• kwm (Interface de KDE)
• mwm (Interface MOTIF)
• sim-CDE
• 
  

Les environnements de bureau (Desktop Environnement)

• GNOME
• KDE
• CDE
• 
  

Les horloges

• xclock
• xdaliclock
• 
  

Les gestionnaires de temps

• GTimeTracker ("gtt")
• karm
• 
  

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Les éditeurs de textes

• Maxwell (pour le Rich Text Format ".RTF")
• Abiword (pour les formats ".DOC" et ".HTML")
• Gnotepad+ (pour le format ".HTML")
• mswordview (pour convertir les fichiers ".DOC" en ".HTML")
• Acrobat (pour le format ".PDF")
• xpdf (pour le format ".PDF" gratuit sous LINUX)
• mwp (traitement de texte de GNOME)
• lyx (traitement de TEX)
• 
  

Les traitements de textes

• Word Perfect de Corel
• Star Writer de Star Division
• Applixware d'Applix
• Abi Word
• Kwriter
• 
  

Les tableurs

• gnumeric
• kspread
• Wingz
• NExs
• 
  

Les suites bureatiques

• Word Perfect de COREL (licence gratuite pour un usage non commercial).
• Star Office de SUN STAR DIVISION (gratuit pour un usage personnel jusqu'à la version 5.2). La suite bureautique Star Office est disponible sur plusieurs plates formes (OS/2, Windows, Macintosh, Solaris, Linux...) . Le traitement de texte Star Writer convertit entre autres les formats ".DOC" de Microsoft WORD afin d'assurer une continuité et une compatibilité entre les documents issus de différentes plateformes.
• Starwriter est le traitement de texte
• Starcalc est le tableur
• Stardraw est le logiciel de dessein
• Starchart
• Starimage
• Starmath
  
• Applixware d'APPLIX
• Open Office est issu des laboratoires de développement de SUN conjointement avec les programmeurs de la communauté Open Source d'Internet. Open Office est distribué selon les termes de la licence GNU/GPL (c'est à dire libre et gratuit). Open Office est une suite bureautique complète (comparable à Microsoft Office), mais qui comporte un peu moins de fonctionnalités que Star Office.
• Siag Office
• K Office
• GNOME Office
• 
  

Les presses papiers

• xclipboard (conserve plusieurs sélections en mémoire)
• klipper
• 
  

Les  agendas

• gnome
• korganiser
• ical
• 
  

Les carnets d'adresses

• gnome card
• kab
• netscape
• 
  

Les bases de données

• Adabas D
• Ingres
• 
  

Les logiciels de gestion financière

• cbb (Check Book Balancer)
• 
  

Les calculatrices

• xcalc
• kcalc
• gnomecalc
• 
  

Les fax

• efax
• 
  

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Les logiciels de retouche d'image

• GIMP (GNU Image Manipulation Programm)
• GTK (GIMP Tool Kit)
• 
  

Les visionneuses (GIF, JPEG, TIFF)

• ee (electronic eye)
• kview
• 
  

Les lecteurs de CD AUDIO

• gtcd
• kscd
• xplaycd
• XFreeCD
• 
  

Les lecteurs vidéo (MPEG, MOV, AVI)

• xamin
• xmpeg
• aktion
• real play
• 
  

Les logiciel de sons (AU, AIFF, WAV, MP3)

• play
• sox (sound exchange pour convertir un fichier son d'un format vers un autre)
• mpg123
• x11amp
• replay
• xmns
• Freeamp
• Xaudio
• 
  

Les mixers de sons

• gmix
• xmixer
• 
  

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Les navigateurs

• Netscape Communicator
• Mosaic
• lynx
• Konqueror de KDE
• 
  

Les moteurs de recherche

• htdig
• Glimpse
• 
  

Les clients de messagerie électronique (mail)

• elm
• exmh
• mh
  
• pine
• netscape
• mail
  
• mutt
• biff
• xbiff
• xmailbox
• kbiff
• kmail
  
• emacs
• tkrat
• 
  

Les clients news (reader news)

• trn
• tin
• slrm
• netscape
• krn
• slrn
• nn
• xrn
• Vnews
• emacs
• 
  

Les clients FTP

• netscape
• gFTP
• ncftp
• ftp
• 
  

Les clients IRC

• xchat
• ircii
• kirc
• 
  

Les serveurs Internet

• in.ftpd
• httpd
• in.telnetd
• inetd
• nfsd
• 
  

Les serveurs de messagerie électronique (POP, IMAP, SMTP)

• fetchmail
• movemail
• ipop3d
• imapd
• 
  

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Les jeux

• Quake
• Doom
• Heretic
• Star Craft
• Civilization: Call to Power
• Freeciv
• Percy
• Xglobe
• Xplanet
• 
  

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Les logiciels d'audit de sécurité

• satan
• nessus
• crack
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